■XyMTeX(キュムテック)■（http://homepage3.nifty.com/xymtex/fujitas3/xymtex/index.html）
この化学構造式フリーソフトの特長：
「XyMTeX(キュムテック)」は、TeXという組版システムを利用して化学構造式を書くことができるフリーソフトです。
コマンド入力が必要なため、複雑な化合物・化学反応式の書くには、それ相応の手間が要りますが、OSを選ばずに使用できるという大きな長所があります。
また、プリントや印刷物になった際の画像の美しさは、特筆に価します。
■ChemLetter■（http://www.vector.co.jp/soft/dl/mac/edu/se052663.html）
このMac用化学構造式フリーソフトの特長：
「ChemLetter」は、テキスト文字を利用して化学構造式を作成できるフリーソフトです。対応するOSはMacのみとなっています。
テキストを用いるため、あまり複雑な分子構造式は描画できませんが、簡易な利用には十分活用できるのではないでしょうか。
付属のテンプレートから、ドラッグ＆ドロップしての使用もできます。また、テキスト文字のみなのでEメールで化学構造式を表記したい場合などにも役立つでしょう。
■ChemBioDraw Ultra（ケムバイオドロー・ウルトラ）■（http://www.hulinks.co.jp/software/cschembiodraw/download.html）
この無料試用期間付き化学構造式ソフトの特長：
化学構造式を化学研究での使用が可能なレベルで描けるプロフェッショナル向け化学構造式ソフト。
三次元モデリングや化学情報管理、構造解析、生物学でのパスウェイを描く為のツールとしての使用も可能です。
製品版は高価ですが、デモ版をフリーでダウンロードすることができます。